Факты по этому делу сообщает газета «Коммерсант». Задержанный и арестованный в сентябре 2010 год гендиректор ООО "Махаон" (ООО "Махаон" одна из организаций, через которую выводились похищенные средства) Вячеслав Хлебников дал показания. Он рассказал, что хищение бюджетных средств организовали должностные лица фонда, причем Магнитский был одним из основных участников аферы. Хлебников утверждает, что именно Магнитский изготовил ложные налоговые декларации для осуществления незаконного налогового возврата. Интересно, что еще два имени, которые также фигурируют в обвинительных показаниях Хлебникова, Октай Гасанов и Семен Коробейников, ответить перед законом уже не смогут: один скончался от инфаркта, второй погиб из-за несчастного случая.
Также издание сообщило, что часть похищенных средств уже обнаружена. Речь идет о 685 миллионах рублей, переведенных со счета ООО "Махаон", они были обнаружены на корсчете КБ "Крайний Север". Средства уже арестованы судом.
Однако представители фонда Hermitage опровергают эту версию следствия:"Пользуясь покровительством руководства МВД РФ и опьянев от чувства безнаказанности, сотрудники милиции, причастные к хищению бюджетных денег, соорудили себе чудовищное и циничное "алиби", обвинив в собственном преступлении обличившего их Сергея Магнитского",— прокомментировали «Коммерсанту» в фонде Hermitage.
Напомним, управляющий партнер аудиторской компании Firestone Duncan Сергей Магнитский был арестован в 2008 году, по верссии следствия он содействовал в уклонении от уплаты налогов в особо крупном размере инвестфонду Hermitage Capital. Он обвиняется в том, что создал схему, благодаря которой Hermitage незаконно снизил налог на прибыль в шесть раз, а налог на дивиденды в три раза, и не доплатил в бюджет более 1 миллиарда долларов. Еще до вынесения приговора Магнитский скончался в СИЗО «Матросская тишина» в ноябре 2009 года. Причиной смерти названа острая сердечная недостаточность.
Смерть Магнитского в московском следственном изоляторе вызвала широкий общественный резонанс.Его сторонники придерживаются версии, что Магнитский погиб "от рук коррумпированных сотрудников российского МВД". Так по версии самого фонда, Магнитский дал показания о причастности нескольких следователей МВД к налоговой афере с компаниями, принадлежащими Hermitage Capital, и ему не оказывали медицинскую помощь, чтобы заставить отказаться от этих показаний. Однако, Следственный комитет при прокуратуре РФ сообщил, что состава преступления в действиях следователей Магнитского, не найдено.