Военно-транспортная обязанность была установлена для своевременного, качественного и в полном объеме обеспечения транспортными средствами войск, военных формирований и органов в период мобилизации и в военное время. Речь в указе идет не только о судах, но и о транспорте в целом.
Порядок учета судов, который планирует скорректировать главное военное ведомство, предполагает составления перечня всех судов, способных выполнять военно-транспортную функцию. Строго говоря, таких перечней два: первый - это перечень морского транспорта, специальных судов и судов рыбопромыслового флота, второй — это перечень внутреннего водного транспорта, специальных судов и судов рыбопромыслового флота. В перечни входят даже такие суда, как тунцеловные, грунтовозы, рефрижераторы, научные и учебные.
Учет судов ведется количественно, по типам и названиям. Им занимаются линейные органы военных сообщений. Они запрашивают у органов, занимающихся регистрацией судов информацию о регистрации, а у органов, уполномоченных на классификацию и освидетельствование судов, они запрашивают информацию о техсостоянии плавсредств. В соответствии в порядком учета, принятом в 2014 году, это они делают ежегодно. Новый порядок предполагает, что такие запросы будут делаться ежемесячно.