Генералу Пукачу, которому, по версии следствия, Кравченко и поручил организовать убийство, предъявлено обвинение по трем статьям УК. Установлено, что 13-14 сентября 2000 года в своем служебном кабинете министр устно отдал Пукачу (тогда начальник ГУКП МВД Украины) приказ убить Гонгадзе. Пукач, действуя из личной заинтересованности и карьерных побуждений, не желая осложнять отношения с руководителем МВД Украины, а также рассчитывая снискать расположение Кравченко и получить повышение по службе, согласился этот приказ выполнить.
Напомним, оппозиционный журналист Георгий Гонгадзе исчез 16 сентября 2000 года в Киеве. В ноябре того же года его обезглавленное тело было обнаружено в лесу вблизи города Тараща Киевской области. Вскоре после этого были обнародованы записи, якобы сделанные экс-майором госохраны Николем Мельниченко в кабинете бывшего в то время президентом Украины Леонида Кучмы. На пленке голос, похожий на голос Кучмы, отдает распоряжение "разобраться с журналистом".
В 2008 году трое бывших сотрудников департамента внешнего наблюдения и криминальной разведки МВД Украины (подчиненные генерала Пукача) были признаны виновными в совершении убийства журналиста.
В июле 2009 года был арестован сам Пукач, который в данный момент находится под охраной СБУ, ему предъявлены обвинения в убийстве Гонгадзе, похищении и избиении журналиста Алексея Подольского, а также уничтожении документов.
Юрий Кравченко, бывший министр внутренних дел Украины, утром 4 марта 2005 года, накануне своего дня рождения, был обнаружен мертвым на своей даче, находящейся под постоянным видеонаблюдением, в элитном поселке "Золотые ворота" в Конче-Заспе под Киевом, с двумя огнестрельными ранениями в голову, произведенными из оружия разного калибра. В тот день он должен был прийти по повестке на допрос в генпрокуратуру Украины по возобновленному после "оранжевой революции" "делу Гонгадзе".
По официальной версии, Кравченко покончил жизнь самоубийством. Куда при этом делся второй пистолет и мог ли выстреливший себе в голову переменить оружие и выстрелить второй раз, не комментируется.