После того, как секретарь Совета безопасности был сменен, общее количество сотрудников его аппарата осталось неизменным, утверждают источники, близкие к администрации президента. Сергей Шойгу, перешедший с поста министра обороны на должность главы Совбеза 12 мая, заменил Николая Патрушева. Эти кадровые изменения потребовали пересмотра структуры Совбеза, по словам собеседников "Ведомостей".
Важной частью аппарата Совбеза является его руководство, включая должность первого заместителя секретаря, которую занимает Рашид Нургалиев. Он входит в расширенный состав Совбеза. Предполагается, что у Шойгу может быть только один первый заместитель, и Руслан Цаликов, бывший первый заместитель Шойгу из МЧС, Подмосковья и Минобороны, по информации "Ведомостей", перейдет в сенаторы.
Однако по-прежнему вакантна должность одного из заместителей секретаря Совбеза из семи. В конце мая Михаил Попов был уволен, но его место пока не занято. Также у Шойгу может быть три помощника, но на данный момент назначений не было. В структуре Совбеза указан только один помощник Шойгу - Дмитрий Грибков, который работал при Патрушеве. Другой помощник, Евгений Аношин, был освобожден от должности в июле.
Согласно источникам "Ведомостей", в Совбезе около двадцати подразделений, занимающихся различными задачами и направлениями работы, такими как вопросы СНГ, безопасность на Кавказе, информационная безопасность, противодействие терроризму и конфликтам, а также проблемы новых субъектов. Работа этих департаментов тесно связана с основными задачами, описанными в положении о Совете безопасности.
Отдельное подразделение представляет секретариат заместителя председателя Совбеза - Дмитрия Медведева. Это одно из крупнейших подразделений Совбеза, включающее примерно полтора десятка человек. Департамент, обеспечивающий работу Шойгу, имеет меньший штат сотрудников. Комплектация структуры Совбеза все еще не завершена.