Как уже сообщал “МК”, ученый был убит 27 февраля 2003 года в доме 44 по Ленинскому проспекту, где он проживал. Его забили до смерти в подъезде гвоздодером и монтировкой. Тогда в качестве основной высказывалась версия убийства с целью ограбления. Кроме того, сыщики проверяли гипотезу о некоем заговоре против деятелей российской науки. В течение 2002—2003 годов в Москве было совершено 4 нападения на ученых — помимо Бугаенко жертвами стали директор Института психологии Брушлинский, завкафедрой РГМУ Коршунов и декан истфака МГУ Карпов. Все преступления совершались в Юго-Западном округе: убийцы подстерегали пожилых граждан в подъездах и били по голове. Выжить удалось только Карпову. Тогда убийства остались нераскрытыми.
А на днях тайну смерти ядерщика Бугаенко приоткрыли детективы, расследующие дело банды Дмитрия Леснякова по кличке Лес. “МК” подробно рассказывал об этой шайке. Лесняков был сподвижником Деда Хасана. Специализацией бандитов были убийства, а заказы поступали от лидеров преступных группировок. Обезвредили гангстеров зимой прошлого года. И вот теперь поступила информация о причастности шайки к смерти ученого Сергея Бугаенко. По версии следствия, это убийство тоже было заказным, но кто за ним стоит, пока остается тайной.