Пирожкова и Бабель познакомились в 1932 году в Москве. Ей тогда было 23 года, ему - 38. К тому времени писатель развелся со своей первой женой Евгенией Гронфейн. С 1934 года они начали жить вместе, а в 1937-м у них родилась дочь Лидия.
В мае 1939 года Исаака Бабеля арестовали по обвинению в антисоветском заговоре. Последующие 15 лет Антонина Николаевна посвятила выяснению судьбы мужа. В 1954 году она получила свидетельство о его смерти с фальшивой датой - 17 марта 1941 года. Позднее в том же году добилась реабилитации Бабеля. Только в середине 1990-х стало известно, что судили писателя 26 января 1940 года, а на следующий день расстреляли за шпионаж в пользу Австрии и Франции.
Антонина Николаевна работала в Метропроекте, проектировала в числе прочего первую очередь московской подземки. В 1965 году вышла на пенсию и занималась изданием наследия мужа. В 1996 году вместе с дочерью переехала в США.